Le Musée organise périodiquement des cycles de rencontres de formation tant pour les opérateurs de la didactique scientifique que pour les enseignants. Le travail mené en synergie avec les et les enseignants prévoit en effet une grande interaction et la nécessité de mises à jour continues surtout sur les preuves scientifiques émergentes.

L’offre de formation peut être inhérente à des sujets spécifiques de compétence du Musée, mais aussi relative à des thèmes de caractère général.