Die prähistorische Sammlung umfasst derzeit 225.000 katalogisierte Funde, die sich auf einen chronologischen Bogen beziehen, der sich von der mittleren Altsteinzeit bis zur frühen Eisenzeit erstreckt und das Ergebnis von Forschungen und Funden ist, die an mehr als 130 Orten im friaulischen Gebiet durchgeführt wurden. Eingeschlossen sind: 
- Steinmaterialien (Feuerstein, Obsidian, Grünstein, Schwerstein),
- Töpfe und Kunstgegenstände aus Ton,
- Waren aus Knochen und hartem Tiermaterial (Knochen, Horn, Bühne),
- Funde aus Metall,
- Tierknochen,
- anthropologische Überreste gefunden.

Die erste Serie, die in der Sammlung inventarisiert wurde, geht auf die Grotte von Robič zurück, eine Höhle nördlich des Staunen-Passes in Slowenien, die Achille Tellini, ein Naturforscher aus dem Friaul, 1894 untersuchte. Weitere Materialien aus verschiedenen Höhlen der Natisone-Täler, wie zum Beispiel Velika Jama, Ciondar des Paganis, Fòran di Landri und Šuošterjova Jama, die in den ersten Jahrzehnten des letzten Jahrhunderts von Mitgliedern des Speläologischen und hydrologischen Vereins Friaul ausgegraben wurden und kürzlich Gegenstand eines neuen Forschungsprojekts wurden.

Nach Forschungen auf dem Gebiet beherbergt die Abteilung die Materialien eines anderen Ortes in den Natisone-Tälern, dem Riparo di Biarzo, und einige neolithische Stätten in der Ebene, wie Sammardenchia (Pozzuolo del Friuli) und Piancada (Palazzolo dello Stella) und Nogaredo al Torre. 

Siehe Bibliographie der Vorgeschichte und Protogeschichte Friaul-Julisch Venetiens .