Il Museo organizza periodicamente cicli di incontri di formazione sia per gli operatori della didattica scientifica che per gli insegnanti. Il lavoro condotto in sinergia con le e gli insegnanti prevede infatti una grande interazione e la necessità di continui aggiornamenti soprattutto sulle evidenze scientifiche emergenti. 

L’offerta formativa può essere inerente argomenti specifici di competenza del Museo, ma anche relativa a tematiche di carattere generale:

Eudemonia. Esplorazione sensoriale e laboratorio sul divertimento nei musei   -  12 dicembre 2025;

Ecologia dei corsi d'acqua del Friuli Venezia Giulia  -  marzo 2025;

De-colonizzare il Museo. Workshop per educatori, operatori museali, insegnanti, museologi, arte-terapeuti  -  25 febbraio 2025.

Essere Museo. Dialoghi e riflessioni al Museo Friulano di Storia Naturale  -  21 settembre e 1° ottobre 2026.